一、基础费用

工商注册费：目前在南京注册公司，工商注册本身是免费的。但是如果您选择委托专业的工商代办机构来办理注册手续，可能需要支付 500 元到 800 元不等的代办费用。

注册资本：现在实行认缴制，创业者在注册公司时可以暂时不缴纳注册资本，这部分费用可暂不考虑。不过，如果您选择实缴部分或全部注册资本，就需要准备相应的资金。一般来说，小公司的注册资本可根据自身业务需求和实际情况确定，没有严格的金额限制。

刻章费：公司注册完成后，需要刻制公章、财务章、发票章、合同章、法人代表章等印章。刻章费用大约在 600 元到 900 元之间。

二、其他必要费用

注册地址费用：注册公司需要有商用性质的地址。如果您有自己的商用房产，那么这部分费用可以忽略不计；如果没有，就需要租赁办公场地或使用挂靠地址。租赁办公场地的费用差异较大，根据地段、面积等因素，每月租金可能在数千元到上万元不等。而使用挂靠地址的话，每年的费用大概在 2000 元到 4000 元。

银行开户费用：各家银行的开户费用及后续的管理费用有所不同。开户基本免费，但每年的管理费用一般在 400 元到 1000 元之间。此外，办理企业银行网银 U 盾，一个大概 20 元到 60 元不等。

税务登记及相关材料费用：税务登记本身是免费的，但办理过程中可能需要支付一些材料的打印、复印费用，大约几十元。

三、可能产生的额外费用

验资报告费：如果您选择实缴注册资本，那么就需要会计师事务所出具验资报告，费用一般在 1500 元到 2000 元。

社保开户费用：如果您的公司需要为员工缴纳社保，那么还需要进行社保开户。这部分费用主要是一些材料的准备费用，相对较少，也是几十元左右。不过，后续每月需要为员工缴纳社保费用，具体金额根据员工工资和社保缴纳比例确定。

代理记账费用：公司注册完成后，需要进行记账报税等财务工作。如果您自己有财务知识和时间精力，可以自行处理；如果没有，委托代理记账机构是比较常见的选择。小规模纳税人代理记账每年的费用在 1800 元到 3600 元之间，一般纳税人则在 4000 元到 6000 元左右。

总体而言，在南京注册一个小公司的费用最低可能在 3000 元左右，如果涉及到租赁办公场地、实缴注册资本等情况，费用会相应增加。创业者在注册公司之前，最好根据自己的实际情况做好预算和规划。